Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC80Q76M96 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms