Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC174Q6PII3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms