Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDF6Q6KF10 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms