Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM236Q5W0B7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms