Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LACTB2Q53H82 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms