Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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