Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MICAQ29983 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MICAQ29983 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MICAQ29983 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms