Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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