Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms