Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNHIT3Q15649 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms