Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERV3-1Q14264 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms