Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2Q13563 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms