Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms