Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PTPN13Q12923 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PTPN13Q12923 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PTPN13Q12923 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PTPN13Q12923 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PTPN13Q12923 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PTPN13Q12923 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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PTPN13Q12923 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PTPN13Q12923 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms