Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C2orf54Q08AI8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms