Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RHDQ02161 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms