Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms