Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms