Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB38P57729 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms