Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NME5P56597 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME5P56597 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME5P56597 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME5P56597 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms