Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCA2P51531 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA2P51531 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms