Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DDIT3P35638 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms