Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms