Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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