Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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