Protein–RNA interactions for Protein: O94900

TOX, Thymocyte selection-associated high mobility group box protein TOX, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOXO94900 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOXO94900 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOXO94900 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOXO94900 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOXO94900 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOXO94900 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOXO94900 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOXO94900 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TOXO94900 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOXO94900 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOXO94900 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TOXO94900 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOXO94900 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOXO94900 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOXO94900 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TOXO94900 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOXO94900 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOXO94900 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOXO94900 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOXO94900 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOXO94900 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOXO94900 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms