Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBXN7O94888 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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