Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRT4C9JH25 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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