Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms