Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA9Q9UGM1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA9Q9UGM1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms