Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms