Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFGAP3Q9NP61 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms