Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms