Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SAMD8Q96LT4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms