Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIC2Q96JB3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms