Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms