Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms