Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TOPBP1Q92547 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOPBP1Q92547 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms