Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-223ENST00000494397 1752 ntTSL 523.94■■□□□ 1.422e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARNTL-219ENST00000533520 567 ntTSL 423.87■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 PTGDS-209ENST00000492068 754 ntTSL 223.33■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 TM7SF3-205ENST00000535819 788 ntTSL 322.74■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 PTGDS-207ENST00000460340 616 ntTSL 221.55■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-212ENST00000454164 747 ntTSL 521.34■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SNX1-210ENST00000560260 1326 ntTSL 1 (best)21.29■■□□□ 12e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SNX1-206ENST00000559389 753 ntTSL 521.27■■□□□ 12e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GAB2-206ENST00000530915 567 ntTSL 421.12■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 MCTP2-209ENST00000561608 796 ntTSL 521.04■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CHD3-204ENST00000439235 1263 ntTSL 520.96■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 RAB31-211ENST00000583137 714 ntTSL 320.91■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GSTP1-205ENST00000494593 1681 ntTSL 220.7■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 URGCP-203ENST00000426198 885 ntTSL 220.46■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 URGCP-211ENST00000477768 500 ntTSL 420.46■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-215ENST00000461739 614 ntTSL 320.19■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARNTL-214ENST00000529388 610 ntTSL 420.01■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-210ENST00000442172 880 ntTSL 319.56■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-222ENST00000494302 2667 ntTSL 519.51■□□□□ 0.714e-7■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 PLK3-204ENST00000465443 2477 ntTSL 519.39■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GAB2-203ENST00000526030 650 ntTSL 318.95■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 HSPD1-207ENST00000439605 578 ntTSL 418.34■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-207ENST00000420383 2817 ntTSL 218.31■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GOLGA4-209ENST00000450863 1617 ntTSL 518.28■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 DDX54-209ENST00000551912 458 ntTSL 218.17■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CDC42EP1-203ENST00000430687 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.9■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-205ENST00000404127 3232 ntTSL 517.85■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GAB2-207ENST00000534823 568 ntTSL 317.77■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-219ENST00000470209 2889 ntTSL 517.74■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-218ENST00000467421 798 ntTSL 217.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SNX1-203ENST00000558040 774 ntTSL 517.18■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITGB1BP1-214ENST00000483795 1913 ntTSL 216.86■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)16.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GOLGA4-203ENST00000419177 760 ntTSL 316.41■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ZNF185-207ENST00000436731 2120 ntTSL 516.24■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITGB1BP1-215ENST00000484735 540 ntTSL 316.23■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SPAG7-208ENST00000575784 694 ntTSL 315.67■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 PSMC4-206ENST00000601697 1623 ntTSL 215.42■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITGB1BP1-209ENST00000464228 861 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CHMP4A-207ENST00000533523 1266 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITPR1-213ENST00000481415 552 ntTSL 415.08■□□□□ 02e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 LRRC8C-204ENST00000482063 504 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITGB1BP1-208ENST00000463190 570 ntTSL 214.61□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 PSMC4-203ENST00000593455 1532 ntTSL 514.57□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITGB1BP1-217ENST00000490426 1027 ntTSL 214.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 ITGB1BP1-220ENST00000497031 560 ntTSL 314.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 GOLGA4-205ENST00000431105 568 ntTSL 314.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 CHD3-205ENST00000449744 880 ntTSL 214.02□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 29
DGCR8Q8WYQ5 PSMC4-204ENST00000596386 929 ntTSL 214.01□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 29
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