Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SVOPQ8N4V2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVOPQ8N4V2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms