Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00523Q86TU6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00523Q86TU6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms