Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms