Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms