Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms