Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms