Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Q1T7F1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
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