Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCK2Q16822 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms