Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LAMB3Q13751 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms