Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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