Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms